Los X-Men son un grupo de superhéroes que, a diferencia de otros, no nacieron con sus poderes ni los obtuvieron por un accidente científico. Ellos son mutantes: personas que poseen un gen especial, el "Gen X", que les otorga habilidades extraordinarias al llegar a la adolescencia.
Debido a que son diferentes, el resto de la humanidad les teme y los rechaza. Por eso, el Profesor Charles Xavier, un poderoso telépata, fundó la "Escuela para Jóvenes Talentos". Allí, enseña a los mutantes a controlar sus dones con un doble objetivo: proteger a un mundo que los odia y buscar la paz entre humanos y mutantes.
Su historia principal es una lucha constante entre dos visiones: la del Profesor X, que cree en la convivencia pacífica, y la de su antiguo amigo Magneto, quien considera que los mutantes son el siguiente paso de la evolución y deben dominar para sobrevivir.